Kemungkinan gejala dan tanda lupus oleh ginjal, jantung, dan sistem saraf.
Sistem ginjal: Penyakit ginjal pada lupus (lupus nefritis) juga bervariasi dari ringan hingga berat. Penyakit ginjal berat seringkali membutuhkan obat penekan kekebalan tubuh. Tanda awal penyakit ginjal bisa dideteksi dengan tes urine rutin (urinalisis). Pada akhirnya, biopsi ginjal mungkin diperlukan untuk menentukan penyebab penyakit ginjal sebagai terkait lupus dan juga untuk menentukan stadium penyakit ginjal untuk panduan perawatan secara optimal. Biopsi ginjal sering dilakukan dengan aspirasi jarum halus ginjal di bawah bimbingan radiologi, namun dalam keadaan tertentu, biopsi ginjal dapat dilakukan selama operasi abdomen terbuka.
Jantung dan pembuluh darah: Peradangan kantung di sekitar jantung (perikarditis) adalah bentuk paling umum dari masalah jantung pada penderita lupus. Hal ini menyebabkan nyeri dada dan bisa menyerupai serangan jantung. Selain itu, pertumbuhan bisa terbentuk di katup jantung yang menyebabkan masalah jantung. Pengerasan arteri (aterosklerosis) dapat menyebabkan angina (nyeri jantung) dan serangan jantung pada pasien lupus yang membutuhkan terapi prednison jangka panjang untuk penyakit berat atau yang telah mengalami pembengkakan yang tidak diobati. Pada beberapa orang dengan lupus, suplai darah arteri ke tangan dapat mengalami interupsi intermiten akibat spasme pada arteri. Hal ini menyebabkan keputihan dan kebiruan di jari-jari yang disebut fenomena Raynaud. Hal itu disebabkan oleh kejadian emosional, rasa sakit, atau suhu dingin.
Sistem saraf: Otak (lupus serebral atau lupus cerebritis) dan masalah saraf dan sindrom kejiwaan akut terjadi pada sekitar 15 persen pasien dengan lupus. Gangguan potensial meliputi kejang, kelumpuhan saraf, depresi berat, psikosis, dan stroke. Peradangan sumsum tulang belakang pada lupus jarang terjadi tapi bisa menyebabkan kelumpuhan. Depresi sering terjadi pada SLE. Terkadang berhubungan langsung dengan penyakit aktif dan terkadang menimbulkan kesulitan emosional dalam menghadapi penyakit kronis atau dengan obat yang digunakan untuk mengobatinya, terutama prednison dosis tinggi.